在无尽的拉格朗日中构建最佳阵容的核心在于理解舰船类型的功能定位与技能互补关系。战斗舰、运输舰和探索舰三大类舰船各司其职，而战斗舰又可细分为前排防御型、中排火力支援型和后排输出型。前排需要高护甲与结构值承担伤害，中排需兼顾治疗与持续输出能力，后排则应配置高爆发或特殊攻击手段。技术研究解锁的舰船改装系统允许玩家通过武器系统、装甲系统和辅助系统的差异化配置实现功能互补，例如将能量武器与实弹武器混合编组以应对不同护甲类型的敌人。
资源分配与战术定位的平衡是阵容构建的第二层逻辑。小型舰船虽单舰性能有限，但通过数量优势可形成对中型舰的有效压制；大型舰船如战巡和航母则需要合理规划指挥值占用，通常采用增援功能突破编队限制。防空类舰船应当根据敌方航母配置动态调整，维修舰在前期副本中效果显著但后期需替换为输出单位。攻城型舰船需单独编组高速机动部队，其攻城属性与移动速度的平衡直接影响拆毁敌方建筑的效率。
技能联动的时序控制是阵容发挥上限的关键。狩猎者级驱逐舰的策略技能可缩短林鸮战机32秒攻击持续时间至20秒，提升15%-20%输出效率；艾奥级指挥技能通过指挥值压制可封锁敌方撤退路线30秒。舰载机搭载平台的选择直接影响制空权争夺，蜂巢护航艇与星云脉冲的混合编组能同时应对舰船与战机目标。曲率航行与普通航行的切换时机也属于广义的技能互补范畴，高速侦查舰先行定位再增援主力可大幅缩短远征时间。
阵容的适应性调整需考虑星系环境与版本变动。辐射区作战需要配备特殊抗性的舰船如艾奥级巡洋舰，而常规资源区则优先保障采集效率。当前版本中，针对航母编队的饱和输出阵容（如猎兵级+蜂巢的组合）具有较高战术价值，但需注意敌方可能采用的反舰无人机反制。技术值加点的优先级也会随版本更新而变化，大型舰载机系统的冷却缩减与伤害提升通常优于装甲系统的边际收益。
后期阵容的终极形态往往体现为多舰队协同作战体系。主力舰队通常由战巡与航母构成核心，搭配防空驱逐舰与护卫舰；高速拆家队专注于破坏敌方建筑与前哨站；工程舰队则需配置仓储舰提升资源采集效率。封锁战术中需要专门编组刷野怪的经验舰队，其舰船选择以低战损为前提。真正的技能互补不仅存在于单支舰队内部，更体现在不同功能舰队之间的战略配合上，这也是无尽的拉格朗日区别于传统SLG的核心策略深度。
